Análisis del desorden estructural en el proteoma de adenovirus humano

RESUMEN Los adenovirus humanos (AdH) son agentes infecciosos ubicuos relacionados con enfermedades respiratorias, conjuntivitis y gastroenteritis; además se ha propuesto que algunos serotipos como AdH 36 son factores etiológicos de obesidad. Por otro lado, la facilidad con la que puede ser manipulado su genoma y la posibilidad de generar altos títulos virales han llevado a que los AdH se empleen como vectores para terapia génica y terapias anti-cáncer. Por lo anterior, conocer cada aspecto del ciclo de replicación viral, asi como el funcionamiento de las proteínas virales es de suma importancia. Hasta la fecha se han identificado algunas de las actividades asociadas a la mayoría de las proteínas de los AdH, sin embargo, aún se desconocen los mecanismos moleculares implicados; en la mayoría de los casos, al menos en parte, debido a la falta de información estructural. Las proteínas intrínsecamente desordenas (IDPs) y las regiones intrínsecamente desordenadas (IDRs) se definen como proteínas o segmentos polipeptídicos que no poseen una única estructura tridimensional. Las IDPs e IDRs se relacionan con la capacidad de interaccionar con diferentes blancos moleculares, lo que le puede explicar la multifuncionalidad de las proteínas con estas características. Se ha propuesto que el nivel de desorden en las proteínas está relacionado con las funciones de esta y con el tipo y número de moléculas con las que interacciona. El análisis de las IDPs e IDRs en el proteoma de AdH resulta útil para comprender la multifuncionalidad de las proteínas virales, asi como su mecanismo de acción. Hasta la fecha el rol de las IDPs/IDRs en el ciclo de replicación de AdH no ha sido evaluado. En el presente trabajo se evaluó la prevalencia de IDPs e IDRs en el proteoma de AdH. Se observó que 20 de las 34 proteínas codificadas en el genoma viral presentan IDRs y que 7 de esas 20 son clasificadas como IDPs. El análisis reveló que en las proteínas estructurales el porcentaje de residuos desordenados está relacionado con la proximidad al DNA en la cápside viral y con el número de interacciones que establece cada proteína. En el caso de las proteínas no estructurales se observó que el porcentaje de aminoácidos desordenados es mayor en las proteínas relacionadas con la replicación del DNA, la transcripción y el procesamiento de los RNA virales, mientras que las proteínas virales con actividades enzimáticas, asi como las proteínas encargadas de regular el tráfico vesicular e inhibir la respuesta inmune de las células presentaron bajos niveles de IDRs.